大便失禁的机制尚不完全清楚，它取决于许多因素：大脑功能、粪便的容量和浓度、结肠的通透性、直肠的扩张性、肛门括约肌的功能、肛门直肠的敏感性以及肛门直肠反射等，其中任何1个或以上因素的异常都可能导致大便失禁。
大便失禁的治疗方法有药物、物理疗法和手术治疗。
药物治疗：
可以通过止泻剂、三环抗忧郁剂等来改变大便的浓密程度，平日多增加纤维质的摄取也会有帮助。假如是由于便秘导致的大便失禁，可以用一些泻剂。
手术治疗：
大便失禁以骨盆肌型异常为主，联合物理治疗与手术治疗对改善大便失禁效果明显优于单用治疗。
对于与便秘和腹泻有关的大便失禁患者，应采取保守治疗，同时教育病人调整饮食和大便习惯，或使用药物改变大便粘稠度。
理疗
教导病人练习放松腹部肌肉同时收缩肛门括约肌，训练方法包括在肛门口放一水球。当水球涨满时，肛门括约肌可以开始收缩，或用肌电图辅助，观察括约肌收缩的程度。理疗的成功取决于患者配合的程度和患者对肛门部分感觉缺失及括约肌松弛的患者的物理治疗效果。
